徐斯文，工学博士，广东药科大学-医药信息工程学院-生物信息系-讲师，主讲《基因组信息学》，《系统生物学》，《生物信息学综合课程设计》，《科研训练》等。

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生物信息算法及可视化软件开发

基因组信息学：高通量测序数据分析，单细胞测序数据分析

整合基因组学：多组学整合分析，组学数据与生物医学图像整合分析

《基于单细胞多组学数据的三阴性乳腺癌变异调控位点识别研究》，编号：A2024252，金额：0.5万，课题来源：广东省医学科研基金项目，身份：项目负责人，项目起止时间：2024.04至2026.04；

《基于多组学测序数据的基因调控元件识别及其可视化平台开发》，编号：pdjh2024a209，金额：4.5万，课题来源：广东省科技创新战略专项资金，身份：项目指导教师，项目起止时间：2024.03至2026.03；

《基于单细胞ATAC-seq数据的骨肉瘤基因组非编码区调控性变异位点识别研究》，编号：2023A04J0861，金额：5万，课题来源：广州市基础与应用基础研究专题，身份：项目负责人，项目起止时间：2023.04至2025.03；

《基于单核苷酸变异的多样品单细胞数据混样拆分技术的实现与应用》，编号：GDSC18006，金额：4万，课题来源：广东省单细胞技术与应用重点实验室开放基金，身份：项目负责人，项目起止时间：2023.01至2023.12；

《基于病理基因组学与深度学习的卵巢癌早期免疫细胞浸润程度分析研究》，编号：XGPX20201，金额：2万，课题来源：医药信息工程学院院级培育基金重点研究项目，身份：项目负责人，项目起止时间：2023.01至2024.12。

[1]     Zenghui Liu, Shaodong Chen, Tianting Li, Chao Zhang, Yuyan Luo, Junxi Zheng, Zixiao Lu, Jin Yang & Siwen Xu. (2024). Linkage: an interactive shiny app and R package for linking of DNA regulatory peaks to genes. bioRxiv preprint.

[2]     Siwen Xu, Weixing Feng, Zixiao Lu, Christina Y. Yu, Wei Shao, Harikrishna Nakshatri, Jill L. Reiter, Hongyu Gao, Xiaona Chu, Yue Wang,Yunlong Liu. (2020). regSNPs-ASB: A computational framework for identifying allele-specific transcription factor binding from ATAC-seq data. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 8, 886. (影响因子 = 6.06, 中科院二区)

[3]     Siwen Xu, Zixiao Lu, Wei Shao, Christina Y. Yu, Jill L. Reiter, Qianjin Feng, Weixing Feng, Kun Huang, Yunlong Liu. (2020). Integrative analysis of histopathological images and chromatin accessibility data for estrogen receptor-positive breast cancer. BMC Medical genomics. (影响因子 = 3.62, 中科院三区)

[4]     Siwen Xu, Ying Wang, Huan Liu, Duojiao Chen, Hongyuan Bi, Weixing Feng. (2017). A new method for alleviating sequence-specific biases in DNase-seq. International Conference on Electronics Instrumentation & Information Systems (EIIS). (国际会议论文)

[5]     Yulong Zhang, Siwen Xu, Zebin Wen, Jingyu Gao, Shuang Li, SM Weissman, Xinghua Pan. (2022). Sample-multiplexing approaches for single-cell sequencing. Cellular and Molecular Life Sciences 79 (8), 1-23

[6]     Zixiao Lu, Siwen Xu, Wei Shao, Yi Wu, Jie Zhang, Zhi Han, Qianjin Feng, Kun Huang. (2020). Deep learning-based characterization of tumor-infiltrating lymphocytes in breast cancers from histopathology images and multiomics data. JCO Clinical Cancer Informatics. 4, 480-490

2021.01 - 2021.12   南方医科大学-基础医学院-广东省单细胞技术与应用重点实验室  博士后（导师：潘星华）

2018.02 - 2020.09  美国印第安纳大学-医学院-计算生物与生物信息中心  联合培养（导师：Yunlong Liu）

2014.09 - 2021.06    哈尔滨工程大学    智能科学与工程学院    硕博连读（导师：冯伟兴）

2010.09 - 2014.06    哈尔滨工程大学    核科学与核技术学院    本科